故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天，因意外一名外星人从宇宙坠落。失去过往记忆的外星人“奥美迦”化身为地球人模样，被人称为“宙人”。他对人类充满好奇，积极地接触这些陌生的生命体。当神秘巨型生物接连出现时，尘封的记忆碎片被唤醒，宙人脱口而出“怪兽”二字。面对怪兽的威胁，强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼，与怪兽作战。随着故事推进，来自外星的宙人与一位普通青年逐渐成为并肩作战的伙伴。
寒假。三年级学生户方美里奥来看望一年级A班的学生，他们不能走出宿舍，有很多空闲时间。他带来的，是后援部门打造的卡牌游戏《英雄之战》！A组的成员们立刻开始比赛，但是这个每个英雄都使用自己的卡牌的游戏并不像英雄英雄看起来那么容易……！卡牌对战的胜利者到底是谁……！？
本田透（堀江由衣 配音）是一名单纯善良的女子高中生。母亲过世后，无处可去的她在误打误撞之中住进了校草草摩由希（久川绫 配音）的家中。草摩由希家里有十二口人，很快，本田透就发现了他们身上的秘密。原来，草摩家族里流传着一个诅咒，那就是他们每个人都对应着十二生肖里的一种动物，另外一个，则是猫妖。个性冷淡，非常内向的草摩夹（关智一 配音）、幽默风趣的草摩紫吴（置鲇龙太郎 配音）、活泼可爱积极乐观的草摩红叶（斋藤彩夏 配音）、有着复杂过去的草摩波鸟（井上和彦 配音），在知道了这些表面开朗的人们背后隐藏的伤痛后，本田透会怎样给予治愈呢？
