天才脑科学家白月魁为救恩师霍恩进行了脑移植术，却不想霍恩受到西弗残存意识的影响......琼斯盗取了天使再生剂注射到19号实验体上引起了一系列异变。同一时间，久川市因为瘟疫感染变成了一片人间炼狱，市长白靖宇和人工智能ASH为了抵御联盟的入侵誓死不降，却不想等到一切尘埃落定之时，真正的末日却来临了……
孤单伫立于京都寺町三条商店街的古董店“藏”。女高中生真城葵偶然地与“藏”店主的儿子家头清贵相识，并开始在“藏”打工。清贵虽然言行举止很温和，却具备令人恐惧的敏锐直觉，人称“福尔摩斯”。葵和清贵一起，开始受理与客人所带来的古董有关的各种各样的委托。
