《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
全民转职时代来临，男主角魏逍转职成为隐藏职业“亡灵召唤师”，开局一把破铁铲，抬手召唤骷髅法师，无限爆兵平推BOSS，仅凭一人灭全图！骨海降临，众生臣服，执掌生死，一人成军，从此世间流传着一种说法：魏逍，即是天灾！
