《萌宝战警》讲述了豆丁、可乐、可诺、石头四位天性正义善良的小朋友借助机甲武装的神奇力量，组成战队，在重重困难面前，众人齐心协力，善用科学，勇往直前，不畏艰险，用勇气与智慧战胜邪恶势力科学怪咖“铁算盘”，保卫家园小石城并寻找神秘失踪的豆瓣博士。
四大宗门之首的玄灵宗，多年来第一次来临水城选拔弟子，方秦两家围绕这一个将决定二者命运的契机，展开明争暗斗。最终，秦南依靠潜心修炼、绝佳天资以及奇遇所得的战神之魂，在使者萧轻雪的公正判罚下，成功扭转颓势战胜方家。进入宗门后，秦南因卷入萧轻雪被逼婚一事，惹来宗主之子欧阳君的仇视。为了不断变强，报答萧轻雪的知遇之恩，秦南屡破强敌，连夺万象大比、外门大比第一、与四大宗门天才共闯武缘阁，并获得搅动大陆的惊天秘密，与冷锋约战生死殿、破北海家围困临水城之难，探索九字真言塔，誓与宗门恶势力战斗到底。
万圣天尊林飞主宰全球灵气复苏后，世界各国修仙界群雄井起，位于大夏东侧的乌国部夏国传承，派出高手偷袭却被林飞轻松击败。谁知对方不仅没有收手。反而召唤上古神明想要逆风翻盘，为了永绝后患，林飞直接术妄图作恶的众神全部解决，从此鸟国再也无力優扰大夏。随后林飞为了调古天魔神言，和道倡瑶光起乔装潜入，经过一番调查，天魔神吉的阴谋也终于浮出水面。
