用真诚善良美好来守护世界的三位天女和少年蓝天在经历混沌族大战后，遇到了新的危机—逃窜的混徒基拉度利用被抛弃玩偶的怨气卷土重来，大肆破坏人类世界的环境和安全，为了清除混乱元素，天女们踏上了寻找奏舞灵器的旅程。面对转学而来的任尔心的挑拨和捣蛋玩偶的阻碍，天女们不言放弃，战胜重重困难终于获得了奏舞灵器，不料基拉度偷走了奏舞灵器和朵法拉，召唤出混徒军团，计划在日食日解除混沌王也伮封印再次颠覆世界。为了人族所处的这个美丽的星球，瑞雪再天堂叔引导下成为新的天女，天女们温暖的关怀让尔心回归，成功拿回了奏舞灵器，正在大肆破坏环境的混徒军团一一被天女们的纯真和爱心净化。大决战时，天女们和混沌王斗智斗勇成功拿回朵法拉，同时成长为节奏天女，混沌王被消灭，世界继续在主张维护环境关爱内心的天女们的守护下继续美丽祥和
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在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
