即将废社的时濑高中筝曲社。来到只身一人的社长面前的是不良少年和他的朋友们，以及古筝的天才少女。各自各自的古筝之乐所编奏的青春学园物语——
特别喜欢游戏和金平糖的高中生白柳启，有一天，被一个自称是魅音的神秘女子卷入了战场。 魅音对聚集起来的人们说：“你们已经没有户籍了。” “请成为实验观测器吧。”在场的每人都被给予了特殊的能力参加各种项目。 下定决心要摧毁这一组织的启，以谁都无法预料的能力和罕见的“脑”能力为武器，新时代的头脑派能力战斗开始。
时为公元二二〇五年。是以改变历史为目的的“历史修正主义者”开始对过去实施攻击的时代。被赋予了守护历史这一使命的“审神者”，由他们所唤起的最强付丧神“刀剑男士”。这是，他们以“某个本丸”为舞台，一心一意、开朗明快地生活的“花丸”物语——
