小师爷父亲施随安为磨砺儿子，在绍兴城内散发行侠令。小师爷通过行侠仗义获得十张行侠令便可得到梦寐以求的《师爷宝典》。在这个目标的激励下，小师爷更坚定了乐于助人的信念，用智慧和勇气帮助身边的人，开始了一场寻找行侠令之旅。
第二季故事舞台将以暗流涌动、风雨欲来的地界为背景延伸至更广阔，大人物小人物的恩怨情仇、各势力间复杂的利益斗争、灵界入侵的阴谋始末和主角一行人在乱世洪流中的使命抗争。
在《纳米核心》的里世界中，各位主角配角以及龙套们，都要在“纳米学院”中学习生活。大家在这个世界不那么认真地上课、考试、过着奇奇怪怪的校园日常，并不正经地保护着这个世界，以及不停地用各自的方式向大家“表示友好”。
大乾王朝和太阳神宫大战在即。为了救出被太阳神宫当做女娲魂之碎片带走的小柔，古海决定韬光养晦，积攒人力和财力。此时恰逢大乾王朝神机营统帅李浩然巡查各地，古海得罪李浩然，被贬为斥候，前往恶人谷调查案件。查案途中却得知一个天大的秘密：太阳神宫利用谷内恶人在制作新式武器……
