Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
这一年是天保十一年（1840年）。有一次，大饥荒爆发，人们心神不宁，于是恶魔们便化身为人，愚弄世人。角野是距离江户市区较远的一个山村。这个村子里住着一对兄妹，分别是仁太和铃音。两人是年幼时因为某种原因来到葛野的陌生人，但却被大家所接受，和谐地度过了在一起的日子。村子里有一位名叫“Itsukihime”的巫女，随着 Jinta 的成长，他成为了她的保镖。然后有一天，当仁太在森林中执行打败恶魔的任务时，他遇到了一个谈论遥远未来的神秘恶魔。身为巫女的贴身护卫，仁太时常处于死亡边缘，而铃音虽然担心哥哥，却仍开朗勇敢地送他离开。正当白哉履行着巫女“一木姬”的职责时，他的生命却受到了恶魔的威胁。三个人的命运齿轮交叉在一起，发生了偏差。一场大灾难降临到人魔身上，影响了整个时代很长一段时间。从江户到平成。一部日式史诗奇幻小说，讲述一个恶魔穿越 170 年间，不断质疑挥舞剑的意义的故事。
冒险者们向未知发起挑战，诸神因兴奋而热血沸腾， 全世界最为热烈的城市——迷宫都市欧拉丽。位于城市中心，给都市带来无限财富与荣华，潜藏众多混沌的大洞穴——“地下城”。一只怪物在这深渊中诞生。“这里……是哪里……？”围绕着能够与人交流沟通的龙之少女，都市逐渐被卷入前所未有的异常事态中。人与怪物。漫然存在的价值观、常识遭到破坏，冒险者贝尔·克朗尼与女神赫斯缇雅，迎来决断之时。
随着恶魔觉醒，人类世界陷入混乱。性格温柔的男孩与恶魔合体，在神秘好友飞鸟了的指引下，卷入一场残酷、堕落的对抗邪恶之战。
“这是预言哦。你们五人，终会迎来重大的危机。那时，能够保护大家的人是你”小时候曾遭到绑架的高中2年级生·堂岛大介，与儿时的好友剀、露、玛丽玛丽、庆作一起，被卷入了不可思议的现象——“涩谷漂流”。涩谷的中心部跳跃到了300多年以后的“未来”。等在那里的是广袤无边的荒野与森林、散布各处的废墟……以及未来人“revisions”和他们所操纵的巨大机械怪物。
高中生金田一可以说是全日本最白痴的高中生之一，上课老在睡觉，作业从来都是抄和他青梅竹马一起长大的美雪的，什么事情都由美雪帮他扛着。然而，阿一平凡普通的外表下却隐藏着一颗可能世界上最严密精细的头脑。他的爷爷金田一耕助是日本最有名的侦探之一，阿一遗传了爷爷的优秀基因，无论多 么高明的犯罪手法、多么狡诈的罪犯，在他面前都无所遁形！这一系列里，阿一和美雪将会遇到校园七不思议杀人事件、怪盗绅士杀人事件等一系列的恐怖杀人事件，阿一到底怎么拨开一宗宗看似毫无头绪的杀人案的迷雾？
