千辛万苦在一起的三云华（深田恭子）和樱庭和马（濑户康史），因为L一族对外身分已是死亡，所以只能采事实婚，原本属于搜查一课的精英刑警和马，也因这段恋情被贬到地方警署，同时和华结婚的事，也必须严格保密，对外宣称单身。此时，担心着两人的华的父亲三云尊（渡部笃郎）送了栋豪华公寓给他们，权当结婚贺礼。事实上，这栋公寓和尊的新居相连。另一边，华的哥哥三云涉（栗原类）又盯上了一个大目标，L一族再度复活，满心希望和盗贼家业断绝关系、安心享受美满婚姻的华，命运又将如何？
主角·山本大介在年幼时因飞机失事而流落南美的亚玛逊河流，但奇迹的是他能够靠自己一个人生活下去，更在森林中练就一身钢铁般的身躯。但此时邪恶组织·基度想利用古代印加文明征服世界，为了对抗基度，古代印加文明的承继兼守护者巴哥长老对山本大介施手术，并于左臂殖入印加秘宝叽叽腕轮，将他改造而成的神秘战士蜥蜴改造人·假面骑士亚玛逊。大介之后回到日本欲查明自己身世，进而展开与入侵日本的十面鬼率领之基度组织对抗的命运。
警视厅的警部补仪藤坚忍（田中圭饰）专门负责重新调查已确定嫌疑人无罪的冤案。他的工作是找出逃跑的真凶和事件真相，这无疑也暴露出了警察组织的失态。因此，与他搭档的人会被组织疏远，晋升之路也会受阻。这样的仪藤被起了个绰号“死神”。这个破天荒的独狼黑暗英雄仪藤，在负责联络的警官南川芽衣（前田敦子饰）的协助下，每次都和不同的“合不来的搭档”， 一边四处奔走，一边查明各种冤案的真凶和真相。从头到尾，执着地重新梳理证词和证据，将“一度结束的事件”和“搭档们的心”180度翻转。
