日高泉美（比嘉爱未 饰）是制作乙女游戏的游戏公司的总裁，由她监制的游戏《Love My Pegasus》一经发售就在业内引起了巨大的轰动，聚光灯的焦点一下子就汇聚到了泉美的身上。泉美是用真心在制作游戏的，尤其是游戏中的男主角肯特，泉美将自己的全部感情都倾注在了这个虚拟的形象之中，以至于忽略了现实里的感情生活。一天，喝得醉醺醺的泉美意外的邂逅了一名神秘男子，让泉美感到震惊的是，这个男人竟然长得和自己所制作的游戏里的肯特一模一样，之后，泉美得知这个男人叫做五十岚航（渡边圭祐 饰）。虽然样貌相似，但航的实际性格却和肯特大相径庭，于是，泉美决定进行改造计划，将航培养成真正的王子殿下。
这是一个围绕着小提琴、有关父与子的故事… 这一次的敌人是以生命能量为食而生存的吸血鬼族中的Fungaia。与之战斗的人，便是在继承自父亲的工坊中制作小提琴的红渡。尽管依靠腰带的力量，他变身为假面骑士牙，但是对于自己为何能变身，为何不得不战斗，现在还尚未可知。然而，实际上，与Fungaia战斗的并非只有渡一个人。22年前，渡的父亲——音也已经从那时开始与猖獗的Fungaia战斗。 故事一边将渡所在的现在、以及22年前——年轻的音也结婚并生下名为渡的孩子之前——紧密地联系起来，一边发展。 22年前，音也未能铲除的Fungaia不断繁衍，并出现在现代的日本。渡化身为假面骑士牙，将其打倒，并以此形态将过去与现在相连。 然而，存在的并不仅仅只是双眼所能看到的形态。在各个时代生存着的人们的命运，将会与怎样的形态相连呢？为什么Fungaia的出现，会威胁到人类的存在呢？身在其中的渡和音也所背负的命运又是…？ 各种各样的人物，生活在各种各样的时代，故事正在发展。知道这2个时代的人，只有2个…那就是将Fungaia Hunter组织化的岛，以及22年前开始经营咖啡店「Coffee Mall Damour」的木户师傅。沉浮于2个时代的人们，掌握着他们命运关键的，是这2个人，还有父亲所留下的小提琴…！？
