Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
讲述「HELLO WORLD」10年后未来的原创衍生动画片。第1话《Record 2027》、第2话《Record 2032》、第3话《Record 2036》，以3个时间轴描绘的3部作品。
半田清舟（岛崎信长 配音）身为著名书道家半天清明的儿子，有着一段不同寻常的童年。半田拥有英俊的外表和聪慧的头脑，却偏偏性格内向不善言辞，接二连三的误会让他成为了同学们眼中的“怪咖”，而向来笨口拙舌的半田自然无法替自己正名，就这样，校园中关于“半田之壁”传说不胫而走，总是曲解他人好意的半田该如何翻身？总是戏弄半田的川藤鹰生（兴津和幸 配音）、成绩优异具有领导气质的相泽顺一（广濑裕也 配音）、样貌英俊总与半田较劲的二阶堂礼绪（柿原彻也 配音）、 身强体壮的肌肉男筒井茜（细谷佳正 配音）、和半田境遇相似的近藤幸男（山下大辉 配音），在他们的陪伴和帮助之下，半田最终能否走出心灵的桎梏，获得周遭的认同呢？
从京都深处逃出的铃木凛（虎彻 饰）投靠了哥哥曾经就职的东京侦探事务所所长久远美保。与此同时，黑道知名的傀儡大师帝门达也接到了暗杀久远美保的委托。达也认为虎彻会成为自己任务的障碍，于是将目光锁定在了虎彻身上。然而，经过几次交锋，两人逐渐察觉到彼此的存在。最终，委托人自杀身亡，达也也不再有任何理由将虎彻作为目标。从此，达也成为了虎彻的盟友，两人的关系也逐渐亲密起来。与此同时，黑道分裂为东西两方，西方势力的影鳄潜入了达也等人所属的东方势力。这引发了两方黑道之间的冲突，虎彻等人也卷入其中。经过一系列的战斗和事件，黑社会的冲突最终以东方的胜利而告终。
在“超高校级的绝望”带来的“人类史上最大最恶的绝望事件”之下，世界陷入了濒临崩坏的绝境。为了拯救这个充满绝望的世界，“未来机关”由原希望峰学园的校长与师生们集结而成了。其中就包括了曾经打倒了江之岛盾子的苗木诚等78期生。他们在此继续复兴世界的活动，但苗木却被以 庇护“绝望的残党”这一罪名遭到了众人的怀疑。未来机关众人为了苗木的处分而聚集在一起时，却遭到黑白熊的监禁，并被要求进行“最后的自相残杀”。他们的手臂被戴上了奇妙的手环，过了一定时间就会被投以安眠药。不止如此，这其中还存在着“背叛者”，是为了杀掉未来机关而来的人。“为了生存下去，非得找出背叛者并杀掉不可”。不存在“学级裁判”这一规则的自相残杀。杀或者被杀，在这极限状态的死亡游戏中，苗木诚等人被逼入绝境。希望杀死希望的绝望物语开始了。 【主要出场人物】苗木诚（未来机关第十四支部所属）、雾切响子（未来机关第十四支部支部长）、朝日奈葵（未来机关第十三支部所属）、雪染千纱（未来机关第五支部支部长）、宗方京助（未来机关副会长·第二支部支部长）、天愿和夫（未来机关会长·第一支部支部长）。
