故事发生在砂刑历93年。一艘名为“泥鲸”的漂泊船上，生活着513名居民。他们分为两个种族——拥有超能力的“印族”，以及没有超能力的“无印族”，相比于印族，无印族拥有更长的寿命。某一日，一个名为莉柯丝（石见舞菜香 配音）的少女被一位名叫查克罗（花江夏树 配音）的少年发现在了废墟之中，当男孩遇见女孩，命运的齿轮开始了转动。莉柯丝开始了在泥鲸的生活。德高望重即将成为下一任领导人的斯沃（岛崎信长 配音）、对岛屿外的世界充满了好奇的奥尼（梅原裕一郎 配音）、天真可爱不谙世事的萨米（金元寿子 配音），在岛上，每一段相遇都会交织出一段新的乐章。
本田透（堀江由衣 配音）是一名单纯善良的女子高中生。母亲过世后，无处可去的她在误打误撞之中住进了校草草摩由希（久川绫 配音）的家中。草摩由希家里有十二口人，很快，本田透就发现了他们身上的秘密。原来，草摩家族里流传着一个诅咒，那就是他们每个人都对应着十二生肖里的一种动物，另外一个，则是猫妖。个性冷淡，非常内向的草摩夹（关智一 配音）、幽默风趣的草摩紫吴（置鲇龙太郎 配音）、活泼可爱积极乐观的草摩红叶（斋藤彩夏 配音）、有着复杂过去的草摩波鸟（井上和彦 配音），在知道了这些表面开朗的人们背后隐藏的伤痛后，本田透会怎样给予治愈呢？
数千年后的未来，进入宇宙空间的人类，被分为银河帝国与自由行星同盟这两个拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。两国之间的抗争持续了150年，以无边无际的广袤银河为舞台，重复着无止境的战斗。银河帝国的门阀贵族社会的腐败，以及在自由行星同盟中被称为“民主主义的弊端”的群愚政治正侵蚀着两个国家。之后，宇宙历8世纪末，两位天才的登场驱动了历史。“常胜的天才”莱因哈特·冯·罗严克拉姆，以及人称“不败的魔术师”的杨威利。两人率领着帝国军与同盟军，展开了不知道是第几次的冲突。
