2070年，东京上空突然出现了貌似侵略兵器的巨大物体，一时间，日本突然停电，闹得鸡飞狗跳。正当人类陷入困境的时候，不知从哪里又冒出一个与“侵略兵器”大小相仿的大家伙，一番对打之后，危机竟化解于无形。次日，面对新闻界的质疑，日本政府慢条斯理的回答：“啊，那个外星人啊，有的啊。”于是全日本顿时炸了锅，神奈川县天网市的御统中学也未能免了俗，就在大家兴奋不已的这一天，转来了一位名叫“统原无量”的转校生。关于天网市，不，关于地球乃至宇宙的一切秘密就从这一天开始……
以不列颠的统治为目标，为了确定王而准备的选定之剑。拔出此剑之人将被称作“亚瑟”，并获得强大的力量。 但，拔出Excalibur的不止一人。随着力量的大量产生，传说发生泛滥，并引发历史的歪曲。
故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了，小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了!在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
